2 ciltten oluşan “Kur’an-ı Kerim Atlası”nda konular alfabetik olarak sıralanıyor. Araştırmada kaynak olarak Kur'an-ı Kerim, Hadis-i Şerifler, İslam Tarihi kaynaklarının yanı sıra Kitab-ı Mukaddes'e de müracaat edilmiş. Kitapta ele alınan konular, her birisi ciddi bir emeğin ürünü olan yüzlerce fotoğraf ve harita ile zenginleştirilmiş.

Kitabı daha iyi anlayabilmek için, araştırma ve projelendirme sürecine dair hikayesini yazarı Prof. Dr. Ahmet Bedir şöyle anlattı: “90'lı yıllarda, Kur'an'daki mekânların ve ismi geçen şahısların yaşadığı mekânların geniş bir araştırmasını yapmak için kendileri ile müzakere ettiğim değerli ilim adamlarından birçoğu, peygamberlerin yaşadığı yerlerin bilinmediğini ve bilinemeyeceğini ileri sürerek fikirlerime pek sıcak bakmamışlardı. Bununla beraber, faydadan hali olmadığını da ifade etmişlerdi. 1997 yılında Hong Kong Çin Üniversitesi'nde bulunduğum sırada, Kitab-ı Mukaddes ile ilgili birçok çalışma görmüştüm. Bunlar benim daha önceki fikrimi tetikledi. İki yıl içinde, Kur'an hakkında söz konusu çalışmanın bir bölümünü teorik olarak bitirmiştim. Fakat gezmediğim, görmediğim yerlerin nazari olarak kitaplara bakıp yazılmasının fazla bir değer ifade etmeyeceği açıktı. Bu nedenle, araştırmada yazdığım konuların bizzat yerlerini görmemin çalışmayı daha anlaşılır kılacağı kanaati ağır bastı. Bunu düşünürken, geniş bir İslam coğrafyasını gezmek gerekiyordu. Zorluğu bir yana, finans kaynağı bulmak çok zordu. Büyük bir meblağ gerekiyordu.”

Bedir, 1999 yılında “Kuran Atlası” isimli bu projesini, destek ve teşvik görmek ümidiyle bir üniversiteye sundu fakat proje herhangi bir gerekçe gösterilmeksizin reddedildi. Bedir, 2002 yılında projede yaptığı revizyondan sonra yaptığı ikinci başvuruda da aynı olumsuz cevabı aldı. Bunun üzerine, söz konusu çalışmadan geçici süre ile vazgeçti. Sonrasını Ahmet Bedir şöyle anlattı:

“Bu arada "Kur'an Atlası" ismi ile Arap dünyasında kitaplar çıkmaya başladı. Onu takip eden diğer benzeri kitaplar yayınlandı. Bunlar bir emek mahsulü olsa da, hiçbiri benim projelendirdiğim tarzda değildi. Kur'an gibi bir kitaba yakışacak kalite ve ilmî dikkat ve incelikten uzaktı. Her şeye rağmen, benzeri çalışmaları görünce, daha önceki araştırmayı yeniden sürdürmeye karar verdim. Nazari planda yapılmış olan bilgilerin doğruluğunu tahkik etmek ve olayları yerinde görüp incelemek üzere, Mısır, Yemen, Umman, Suudi Arabistan, İsrail, Filistin, Suriye, Kuzey Irak, Ürdün, Lübnan vb. yerleri gezdim. Nazari bilgileri bu gezilerde gerçekleri ile yüzleştirip tetkik ettim. Böylece, “Tevhidin Yurdu Olan Kur'an Coğrafyası”nın metin bölümü tamamlanmış oldu. Tevhid hakikatini yerleştirmeye çalışan peygamberlerin yaşadıkları eziyetleri, çektikleri sıkıntıları, yaşadıkları yerleri görerek, uzaktan ve hayalî de olsa yerinde incelemiş oldum.”