Özellikle CSU’nun Güney Bavyera teşkilatları Beckstein’a karşı isyan bayrağını çekti. Beckstein istifa gerekçesini şöyle açıkladı: "Seçmenlerin güveni benim beklediğimden daha düşük çıktı. Pazar günkü çok acı
seçim yenilgisinden sonra önümüzde duran görevin başarıyla üstesinden gelebilmem için parti içinde de yeterli destek görmedim. Bu nedenle gelecek dönem başbakanlık görevine aday olmayacağım."
Federal hükümette koalisyon ortağı olan Hırıstiyan Demokratlar’ın küçük ortağı CSU, 1960’lardan bu yana ilk kez mutlak çoğunluğu kaybederek seçimlerde ancak yüzde 43.7 oranında oy alabilmişti.